Das Mehrwegsystem funktioniert nach einem einfachen Prinzip. Kauft der Kunde sich einen Kaffee, kann er statt des gewohnten Pappbechers alternativ einen FairCup-Becher erwerben. Den Pfand von 1,50 Euro (1 Euro für den Becher, 50 Cent für den Deckel) erhält er wieder, sobald der Mehrwegbecher zurückgebracht wird. Der Kunde kann den Becher an allen Ausgabestellen, die sich dem Pfandsystem angeschlossen haben, wieder abgeben. Sogar Kaffeeautomaten, wie sie zum Beispiel in Kantinen stehen, können – nach einer kleinen Umrüstung beziehungsweise Ergänzung – mit dem FairCup benutzt werden.